MATEdb: a new phylogenomic-driven database for Metazoa

نویسندگان

چکیده

A recommendation of: Rosa Fernandez, Vanina Tonzo, Carolina Simon Guerrero, Jesus Lozano-Fernandez, Gemma I Martinez-Redondo, Pau Balart-Garcia, Leandro Aristide, Klara Eleftheriadi, Carlos Vargas-Chavez MATEdb, a data repository of high-quality metazoan transcriptome assemblies to accelerate phylogenomic studies https://doi.org/10.1101/2022.07.18.500182

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

A phylogenomic investigation into the origin of metazoa.

The evolution of multicellular animals (Metazoa) from their unicellular ancestors was a key transition that was accompanied by the emergence and diversification of gene families associated with multicellularity. To clarify the timing and order of specific events in this transition, we conducted expressed sequence tag surveys on 4 putative protistan relatives of Metazoa including the choanoflage...

متن کامل

MmtDB: a Metazoa mitochondrial DNA variants database

The present paper describes the structure of MmtDB-a specialized database designed to collect Metazoa mitochondrial DNA variants. Priority in the data collection is given to the Metazoa species for which a large amount of variants is available, as it is the case for human variants. Starting from the sequences available in the Nucleotide Sequence Databases, the redundant sequences are removed an...

متن کامل

a new approach to credibility premium for zero-inflated poisson models for panel data

هدف اصلی از این تحقیق به دست آوردن و مقایسه حق بیمه باورمندی در مدل های شمارشی گزارش نشده برای داده های طولی می باشد. در این تحقیق حق بیمه های پبش گویی بر اساس توابع ضرر مربع خطا و نمایی محاسبه شده و با هم مقایسه می شود. تمایل به گرفتن پاداش و جایزه یکی از دلایل مهم برای گزارش ندادن تصادفات می باشد و افراد برای استفاده از تخفیف اغلب از گزارش تصادفات با هزینه پائین خودداری می کنند، در این تحقیق ...

15 صفحه اول

EverEST – A phylogenomic EST database approach

The use of local similarity search algorithms (e.g. BLAST) against public databases is often the preferred method of choice for screening short expressed sequence tags (EST). The need for automation of processing, similarity analyses, and annotation of ESTs is highlighted in cases when several BLAST results should be analysed in a combined approach. EverEST is a WINDOWS program that automizes d...

متن کامل

Update of MmtDB: a Metazoa mitochondrial DNA variants database

The present paper describes the improvements in MmtDB, a specialised database designed to collect Metazoa mitochondrial DNA variants. Priority in the data collection has been given to Metazoa for which a large amount of variants is available, e.g., for humans. Starting from the sequences available in the Nucleotide Sequence Databases, the redundant sequences have been removed and new sequences ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Peer community in genomics

سال: 2022

ISSN: ['2780-0539']

DOI: https://doi.org/10.24072/pci.genomics.100022